なかのにっき

ちょっと大学に寄って ISSP 会議の準備＋ヤボ用。

2009 の最終回。反省、HP 確認、 次回 2011 へ向けての体制の相談など。 16:00 過ぎに終了。

＠ 0 限: 予備:

＠ 2 限: 物質生命物理:

icc も install.sh でインストール。 環境は /opt/intel/Compiler/11.1/064/bin/ にある iccvars.csh ifortvars.csh を source すれば良いようなので、 ~/.tcshrc に

source /opt/intel/Compiler/11.1/064/bin/ifortvars.csh ia32
source /opt/intel/Compiler/11.1/064/bin/iccvars.csh ia32

を追加。これでコマンドラインから

ifort hello.f
icc hello.c

などで a.out ができるようになった。

展開して misc/readme.unix に沿ってコンパイル。 しかしビルドのスクリプトはともかく (これも Makefile にしてほしいとこだが)、 rungms がナニな代物で動くまで結構面倒だった。 差分はこんなの 。$SCR を /tmp にするのは良いのかどうか。

runall を走らすと examp36 がコケたが、 このとき のようにしたら解決。 しかし exam23 は

  :
 EQLRAT HAS FAILED TO CONVERGE FOR ROOT    2
0*** EVVRSP PARAMETERS ***
 ***      N =        7 ***
 ***  NVECT =        7 ***
 ***   LENA =       28 ***
 ***     NV =        7 ***
 *** IORDER =        0 ***
 ***   IERR =        2 ***
 EXECUTION OF GAMESS TERMINATED -ABNORMALLY- AT Fri Jan 22 16:43:18
 2010

で駄目になる。 このへん と似た環境だけど (うちでは exam30 は大丈夫だった)。 intel compiler のライブラリの問題かなあ。

しまったモロに そのものズバリのページ があった。64 bit version でのコンパイルだけど。うーむ。

とりあえず

setenv CVS_RSH ssh
cvs -d :ext:nakano@babaserv:/home/cvsroot co HISPUT

で checkout、Makefile の FC を ifort に、CC を icc にしてビルドのテスト。 mkl の使い方がまだわかっってないので実行ファイルまで到達せず。 これも来週への宿題ということで。

三菱健保、web から見られるようになったとのことで。 紙で ID/pass。

行けるか危ぶんでいたが参加できた。 18:00〜21:00 に恒例の桃里にて。 参加者の皆様はお元気そうで何より。 でも平均年齢はだいぶ上がってきたなあ。

掃除洗濯クリーニング。

鹿島田へ。諸々偵察。

imageindex を使ってページ作ってご連絡。

到着した。とりあえず刷って boss に見ていただく方向で。

受諾して原稿を拝見した。 し、しかしこれは…(^_^;

第一稿を持ってきてくれたのを次々に見る。 ま、なかなかどのような発表にするかは難しいところ。 しかし「一年前の自分にこれでわかるか、伝わるか」と 自問してもらえれば解決するところも多いと思うんだけど。

物情最後の発表会。といいつつまあ淡々と進行。 ナノ研のひとたちには色々質問したかったんだが、 残念ながら今回は質疑応答の時間があまりなかった。 トリの露木くんはさすがの出来。大変良くわかって非常におもしろかった。

明日線形数学の試験があるとかで、 演習クラスの K くんが部屋へ質問にきた。 がんばってくださいねー (ともう自分の手は及ばないので半ば無責任に応援だけ)。

鹿島田の賃貸物件に決めた。 引越しは順調に行けば来月末くらい。 さらば登戸。しかしだんだん職場から遠くなるなあ。

取ってきた。印鑑証明は車買ったときに作ってたのをすっかり忘れてて、 家にいっぺん取りに戻る羽目に。

3/15 DL の abstract について調べてみる。 ログインして registration しないとテンプレート *1 が入手できないというアホな仕様。 500 words 書けばいいらしい。

---

ビルド。いちおう実行バイナリはできたんだがテストに fail。 ifort/icc から、MKL がちゃんと使えていないっぽい。 gfortran でいけるかと思ったが、 これだと sparse library がひっかかるな。 MKL の SPBLAS を使うのが一番筋が良さそうだ。 ちゃんとマニュアル読んで頑張るか。

という感じで割込み多々。

エビサワさんへケースとクリーンノール手袋 (L)。

• パリティ 2 月号
• 日経サイエンス 3 月号

いろいろ読んでみたりして、結局 spblas (blas) で Ax=b が 解けるのは A が三角行列の場合に限られることが 2h かけてわかった。あほめ。

というわけで pardiso を使えばいいらしい。 こいつが受けとる疎行列データの形式は Compressed Sparse Row といやつらしいが、 Coordinate format との変換は mkl_dcsrcoo という関数でいけるようだ。データ形式については このへん 。

とりあえず 1 変数の spline については完了した。やれやれ。 pardiso はメチャメチャパラメータが多くてやたら大変だった。

intel compiler のパッケージに含まれる manpages を man -k で当たりたいので、 /etc/manpath.config に

MANDATORY_MANPATH                       /opt/intel/Compiler/11.1/064/man

を追加してみたんだが反映されない。mandb -d を (環境変数 MANPATH が無い状況で) 実行すると、

  :
path directory /usr/local/sbin is in the config file
adding /usr/local/man to manpath
adding /usr/local/share/man to manpath
  :
adding mandatory man directories

warning: /usr/man: No such file or directory
/usr/share/man is already in the manpath
/usr/local/share/man is already in the manpath
adding /opt/intel/Compiler/11.1/064/man to manpath
manpath=/usr/man:/usr/share/man:/usr/local/man:/usr/local/share/man:/usr/X11R6/man:/opt/man

で入ってねえ。なんでじゃ。

apt-get source し、ソースを眺めてもいまいちわからんので 深追い しようか…と一瞬考えたが思いとどまった。

9:00〜10:20 49 名。持ち込みアリアリで 80 分の試験が、 ほぼ終了まで皆がんばる、というのはすごいな。

早く来すぎたので監督前に一仕事、 ビルド後のテスト結果を見つつ監督後にデバッグ。 2 次元のスプラインも復元できた。

scatter のところで fpe 例外が出とる。 ifort は -fpe0 -traceback である程度アタリが付く。 しかしやっぱデバッガ使わないとだめ？

普通に dehint から読んでる scint1 での 0 割か。 ふむー。

うーむ散乱角を計算するとき、 運動量の r 成分がちょうどピッタリ 0 になっちゃう状況が発生したせいらしい。 なるほど…さてどう逃げるか。

アスクルへ Z ファイル・はさみ・フロッピーディスク。

結局条件判定を加え、eps を r0 に加える方向で逃げた。 どうやら無事走るようになったみたい。やれやれ。 ではポテンシャルをいじる方向で作業するか。

めもめも。

昨日注文のアスクルの品。26 日にエビサワさんにお願いしたやつも到着。

非常勤の溝口先生の。22 名 80 分。 微妙に恙無くなくもなかったが、まあ無事に終了。

3/19 の午後の 5 番目。あー、卒業式とかぶったなあ。

小島研・山崎研から SiC 系の依頼。 13:00 から立ち上げと測定の基本的なところを lecture、 あとは測定していただく。 ちと当方の時間切れにて 18:30 で一段落していただき、 続きは月曜の方向にて。

図書館で借りて読んでいたのを読了。全三巻。 ゆえあってこのところ帰宅が早いので、自宅で読んでいた。 同著者の B&B はかなり昔 (この日記を書き始める前) に読んだけど、これも凄かった。 1950〜70 年代あたり、マスメディアが技術の進歩によって巨大化し、 これを利用して米国の大統領に権力が集中していく様、 またニュースメディアがこの権力への対立軸として確立していく様、 を、ワシントン・ポスト、CBS、LA タイムズを中心に書いたもの。 大戦後の中国に対するアメリカの対応の話から始まって、 ウォーターゲート事件のあたりまで。

実在の人物を大量に登場させ、 かつ各々をヒーロー化せずに活写し、 目の前で起きている出来事をたいへん面白く読ませつつ、 かつ読了時には歴史の流れを感じさせる、 大変素晴らしい手際。 ちょっと引っかかる訳文が (特に中巻あたりに) ちらほらあったが、 基本的には読みやすい。古い本だけどおすすめです。

いまの「検察対小沢」報道を眺めていると、 いまだ日本だと報道が「権力」としては一本立ちしていない感を受ける。 まあこれはどうでもいい話。

車を転がして各種買い物。

XP 付属の「バックアップ」を使う。 disk は買ってきた IO DATA の HDPS-U500K。 USB バスパワーで 500G 保存できるメディアが 9500 円で買えるのだから、 確かにもうテープの時代ではないわなあ。

ひとつのファイルに固めるので、買った状態で切られていた FAT32 ではだめだった。NTFS にして完了。 2h ほどで完了。アーカイブのサイズは 120G くらい。

「いじくるつくーる」 でできます。

「いじくるつくーる」を立ち上げて、「フォルダのターゲット」をダブルクリックすれば「共有ドキュメント」があります。

• ポータブル HDD HDPSU00K
• カードリーダ CRW12M37

掃除ほか。

同期のみなさんに電話連絡。